Uma das vantagens da ecografia, inclusivamente em relação a técnicas imagiológicas mais recentes como a tomografia ou a ressonância magnética, é a sua possibilidade de visualizar imagens em tempo real o que confere uma perspectiva insubstituível da função de certos órgãos.
As principais aplicações da ecografia são os órgãos da cavidade abdominal, o coração, os tecidos moles do pescoço e o olho. Pode-se ainda aplicar a ecografia ao sistema músculo-esquelético mas em veterinária esse uso restringe-se quase exclusivamente a animais de desporto.
Antes de um exame ecográfico abdominal ou cardíaco os animais tem que ser tosquiados na área correspondente uma vez que o pêlo dificulta ou impossibilita o exame. No caso de um exame abdominal pede-se ainda aos proprietários que tragam os animais dentro do possível com a bexiga cheia. Em determinados tipos de exames abdominais poderá ainda ser pedido o cumprimento de um jejum de algumas horas.
